实验、实习、实训是高职院校重要的实践教学环节。为加强实践教学环节，达到培养实用型人才的目的，提高学生的实践动手能力并实现产学研结合，建工系高度重视实验实训设施建设。现有土工实验室、建材实验室、建筑施工实训场和CAD机房。实验室除具有常规试验设备外还拥有部分国内先进仪器设备，以满足建筑工程系和水利工程系部分专业的实践教学需求。其中土工实验室具有建设厅土工实验室乙级资质，土工、建材实验室具有水利工程实验室二级资质，初步实现了产学研一体化。另外，为加强学生实习效果，建筑工程系与校外29家建筑企事业单位签约建立了学生实习基地，依托建工系技术力量的院办建筑企业曲阜宝胜建筑公司已完成近十万平方米的建筑施工任务。